审计处是学校独立的内部审计机构，是代表学校对校内各项经济管理活动进行审计监督、评价、咨询与服务的职能部门。审计处在学校党委、校长的直接领导下，依据国家法律、法规和政策，以及上级主管部门、学校的规章制度，独立行使学校内部审计的职权，对学校负责并向党委、校长报告工作，同时接受上级审计机关的业务指导和监督。审计处遵循“围绕中心，服务大局，突出重点，求真务实，依法审计”的工作方针，寓监督于服务，通过审计活动促进学校各单位防范风险，完善管理，提高效能，从而促进学校事业目标的健康发展。

为了适应新时代对审计工作的要求，加强党对审计工作的领导，学校于2021年6月成立上海应用技术大学内部审计工作领导小组，领导小组下设内部审计工作办公室，挂靠审计处，负责处理审计日常工作。